Salah satu putra Habib Hasan Assegaf, yaitu Habib Abdullah bin Hasan bin Muhammad bin Hud Assegaf mengatakan, bahwa pada hari Senin (21/12) lalu, Habib Hasan mengeluhkan sakit lambung dan usus. Akhirnya, beliau dibawa ke Rumah Sakit National Hospital, Surabaya, dan tiba di sana sekitar pukul 5 sore. Dari hasil pemeriksaan, ada pembengkakan pada ususnya sehingga Dokter menganjurkannya untuk opname. Kemudian pada hari Sabtu (26/12) malam, Habib Hasan memaksa untuk pulang. Beliau berulang kali melepaskan tabung oksigen di mulutnya. Sehingga, kondisinya malah semakin drop dan dipindahkan ke ICU untuk mendapatkan penanganan yang lebih intens.
Habib Hasan wafat pada hari Minggu (27/13/2020) dalam usia 64 tahun. Jenazah ulama yang dikenal sangat bersahaja dan dicintai oleh banyak kalangan tersebut disholati dan dimakamkan di lingkungan Masjid Agung Al-Anwar, Pasuruan. Diketahui ribuan pelayat hadir untuk mengikuti prosesi pemakaman Habib Hasan Assegaf tersebut di lingkungan Masjid Agung Al-Anwar, Pasuruan kawasan Alun-Alun Kota Pasuruan, Minggu (27/12/2020).
- Habib Ali bin Abdurrahman Assegaf