Selain itu, beliau juga aktif sebagai Ketua Majelis Fatwa untuk PP Mathla'ul Anwar. KH. Tengku Zulkarnain termasuk salah satu Ulama yang aktif bersuara dan memberikan komentar terhadap beberapa masalah dan issu yang sedang hangat diperbincangkan di tengah masyarakat. Banyak sekali masalah yang beliau komentari, mulai dari masalah kerukunan umat beragama di Indonesia, masalah sensor film, pernikahan sesama jenis. Beliau juga aktif berkomentar tentang pemblokiran situs-situs Islam radikal.
Bahkan bisa dikatakan KH. Tengku Zulkarnain ini adalah Ulama yang sangat keras menentang Ahok menjadi pemimpin di Jakarta. Selain aktif menyuarakan penolakannya melalu majelis taklim dan pengajian yang beliau gelar, beliau juga termasuk Ulama yang aktif menggunakan media sosial. Media sosial yang sering KH. Tengku Zulkarnain manfaatkan untuk menyuarakan pendapatnya adalah Twitter. KH. Tengku Zulkarnain sering membuat cuitan-cuitan yang menolak terhadap pemimpin non muslim dan juga mengenai tuntutan untuk mengadili Ahok sebagai penista agama.